NextGENe
O NextGENe é o parceiro analítico perfeito para a análise de dados de sequenciamento de desktop produzidos pelo ION PGM, Roche Junior, Illumina MiSeq, bem como sistemas de alto rendimento, como as plataformas Ion Torrent Proton, Roche FLX, Applied BioSystems SOLiD e Illumina.
Fabricante: SoftGenetics
Descrição detalhada do produto
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O software NextGENe é executado em um sistema operacional Windows, que fornece uma interface aponte e clique para biólogos e não requer scripts ou outro suporte à bioinformática, geralmente necessário ao usar programas como CLC Bio, LaserGene, DNASTAR, MAQ, SOAP, Top Hat, BWA e Bowtie.
O software NextGENe emprega tecnologias específicas de plataforma únicas em um pacote independente de múltiplas aplicações.
O software NextGENe contém módulos de análise para SNP/INDEL e análise de variantes estruturais (ressequenciamento e análise de amplicons), variação do número de cópias (CNV), previsão e descoberta de doenças raras; Alinhamento de Genoma Inteiro; Transcriptoma; Splicing alternativo de exons e níveis de expressão de transcrição; RNA Seq; ChIP-Seq, Análise Serial de Expressão Gênica (SAGE); Expressão genética de genes (DGE), montagem de exoma e descoberta de variantes; Análise e quantificação de miRNA; Metagenômica; montagem de novo, CNV e Exome Capture.
O NextGENe foi desenvolvido em um ambiente Windows compatível com biólogos, reduzindo significativamente a necessidade de recursos e custos adicionais em bioinformática. O NextGENe utiliza hardware baseado no SO Windows de 64 bits e baixo custo.
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